aminoXpress下载

随着计算机技术的发展越来越成熟，与生物化学行业相结合也诞生了许多强大的专业性软件。aminoXpress就是一款专为生物化学行业设计的CAD应用软件，软件集成了生物化学家每天执行的常见功能。还提供了一种新的通过构建模块和相应计数输入序列的协议。这为程序处理非常复杂、分支、循环和冗长的序列提供了可能性。用套用的办法来帮您处理复杂的生物问题，大大增加您的效率。

aminoXpress功能介绍

　　1.氨基酸分析:该模块计算氨基酸分析结果的最佳残基比。通过将水解过程中容易氧化的残留物输入“未优化残留物”部分，可以将对优化结果的影响降至最低。

　　2.复合构建模块组成:该模块基于构建模块(氨基酸、片段)拥有离散的重量值这一事实来识别意外产品的身份。扫描它们的组合后，偏差最小的更有可能是衍生产品。

　　3.消化模式:该模块通过用户定义的酶或化学模式预测消化产物。

　　元素分析:该模块计算序列中不同元素的理论百分比。通过进一步输入每个元素的实验百分比组成，可以识别其经验公式和/或其聚集体。

　　4.碎片化:该模块预测质谱中通过三种类型的键断裂产生的碎片:一氧化碳/一氧化碳、一氧化碳/碳氢化合物和碳氢化合物/碳氢化合物。生成的碎片可以直接导入到质量模块中，用于模拟质量分布模式。

　　5.螺旋轮/网:这个模块显示和操作螺旋结构的顺序轮/网显示。

　　6.同位素分布图:这个模块预测输入公式或序列的同位素分布图，以1到3的电荷变化的或模式

　　7.Lib组合库:本模块预测组合库(如肽库)的质谱，以1-3电荷的或模式进行。直到最后一步才进行质量舍入，以确保准确性。此外，该模块将其预测能力扩展到有机文库:随机变体可以是氨基酸、片段或两者兼有。结果还包括随机的截面残余组合

　　8.主题发现:该模块通过模式识别预测序列中潜在的药物活性位点。它有助于扫描预设模式或随机重复模式、潜在的药效团，以及展示相同生物活性的加载序列。

　　9.分子量:这个模块计算肽和蛋白质的分子量。输入可以通过常规的序列方案进行，也可以通过构建模块如氨基酸和片段进行。替代方案使模块能够计算复杂分子的分子量，例如具有保护基团的肽、肽模拟物、长分子和分支分子等。原子量的进一步使用通常扩展了模块计算任何化合物分子量的能力。

　　辅助描述

　　10.数据库数据库管理:这个辅助模块允许用户管理在这个程序中使用的所有数据库，如氨基酸数据库，片段附加数据库...等等。开放式设计允许用户根据他们的特定项目定制数据库。

　　11.序列序列加载器:这个辅助模块允许用户将序列加载并解析到相应模块的入口部分。专家系统自动识别诸如侧链、环状结构、假替换和附加加合物的属性。

aminoXpress软件特色

　　1.限制性站点指标

　　确认限制性网站适合克隆。独特性，甲基化敏感性，特殊性质以粗体显示独特的限制性位点，或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组，不要被愚弄，因为限制性位点被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点，利用工具提示来避免有问题的限制网站。

　　2.限制性克隆

　　可视化克隆过程的所有方面，如果您已经考虑过程，则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷，则可以捕获并纠正错误。

　　3.PCR

　　模拟标准PCR，使用您自己的引物，或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。

　　4.重叠延伸PCR

　　通过重叠延伸PCR融合片段，最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向，SnapGene将设计引物。

　　5.引物定向诱变

　　使用诱变引物进行定点诱变，选择诱变引物，按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。